從小被喇嘛收養的劉曦（吳京 飾演），與養父吉祥（洪金寶 飾演）一同護送「貢佛天珠」，途中被一班神秘人將天珠盜走。吉祥懷疑那一群神秘人與消聲匿跡多年的「雙子門」有關，於是找「雙子門」傳人校長常忠（元華 飾演）出手幫忙。

「雙子門」是由一組雙胞胎組成，利用他們心靈相通的特質練就特異武術，還使用了樣貌相似之便製造不在場証明，為非作歹。